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Les accords interuniversitaires (AUI) autorisent des échanges avec les universités des cinq continents. Ils concernent les étudiants mais aussi les enseignants, les chercheurs, les personnels administratifs, et même le matériel, les co-tutelles de doctorat et les programmes de recherche.

L'Université Marie et Louis Pasteur a développé des partenariats privilégiés avec une centaine d'établissements d'enseignement supérieur de par le monde, dans des disciplines variées.

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